Généralité
La copro-culture est un examen microbiologique visant à rechercher des micro-organismes particuliers dans les selles ; il a donc essentiellement une finalité diagnostique, mais grâce à l'antibiogramme possible, il peut également être utile de choisir le médicament le plus approprié pour l'éradication du pathogène.
Comment collecter les excréments
La collecte des selles est confiée au patient, assortie du respect de certaines règles visant à la réussite de la coproculture ; voyons-les en détail :
- afin d'éviter la contamination par les urines et les détergents, la défécation doit avoir lieu dans un récipient tel qu'un « pot de chambre », soigneusement nettoyé ; alternativement, il est possible de tapisser les toilettes avec du papier toilette.
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Une fois émises, les selles doivent être collectées immédiatement à l'aide de la spatule spéciale, puis déposées dans le récipient correspondant, en le remplissant jusqu'à la moitié. Si le récipient contient un liquide, celui-ci ne doit absolument pas être vidé mais maintenu en place. Il est très important de prélever les échantillons en trois ou quatre points différents des selles, en prenant soin de les collecter en correspondance avec toute trace de mucus, de sang ou de pus (pour la plus grande probabilité d'y trouver des agents pathogènes).
- Après le prélèvement, le récipient, soigneusement fermé et marqué du nom, du prénom et de la date, doit être immédiatement apporté au laboratoire d'analyses, sinon il peut être conservé au réfrigérateur pendant 12/24 heures maximum. Les bactéries, en effet, peuvent mourir. ou proliférer excessivement et aussi le pH des selles peut subir des changements importants.
- Dans les jours précédant la coproculture, ne pas utiliser de laxatifs, de purges ou de suppositoires pour évacuer. Il est également nécessaire de suspendre toute antibiothérapie, telle que prescrite par votre médecin.
- Ce n'est que dans certains cas, tels que la difficulté à obtenir des selles pendant la petite enfance, que l'échantillon fécal peut être prélevé par écouvillonnage rectal.
- Le matériel doit de préférence être collecté au moment aigu du processus infectieux ; pour augmenter les chances d'isolement des pathogènes, il peut donc être nécessaire d'envoyer au laboratoire trois échantillons prélevés à des jours différents.
- Pendant toute la procédure, il est conseillé de porter des gants en latex et à la fin des opérations, il est conseillé de se laver soigneusement les mains.
ATTENTION : selon l'agent pathogène recherché, les indications fournies par le centre d'analyse peuvent légèrement différer de celles décrites.
Quand est-ce que c'est fait ?
Le médecin peut prescrire la réalisation d'une co-culture pour découvrir l'origine de symptômes gastro-intestinaux évocateurs d'une infection entérique, tels que diarrhée aiguë ou chronique, douleurs abdominales et météorisme sévère.
Une coproculture est utilisée pour rechercher différents types de bactéries ou de virus.
La copro-culture nécessite un milieu d'enrichissement (où les pathogènes peuvent se multiplier dans des conditions optimales) et une méthodologie spécifique. Elle doit donc être réalisée sur la base d'une suspicion clinique bien précise.
La coproculture standard implique la recherche de : Salmonella spp. Shigella spp. et Campylobacter spp., toutes bactéries responsables d'infections intestinales transmises par la consommation d'eau ou d'aliments contaminés et typiquement associées à de la diarrhée, des douleurs abdominales, une fièvre plus ou moins élevée et la présence de mucus ou de pus dans les selles (rare dans la campylobactériose).
D'autres micro-organismes qui, si nécessaire, peuvent être recherchés dans les fèces (coproculture étendue) sont : Yersinia spp. 157 (VTEC) - Vibrio spp (y compris le choléra) - Aeromonas spp. - Bacillus cereus (+ toxine) - Staphylococcus aureus (+ toxine) - Clostridium spp. (+ toxine) - Streptococcus agalactiae - Champignons.
Chez les patients pré-pédiatriques, la coproculture se concentre également sur la recherche de Rotavirus, responsables de gastro-entérite (diarrhée et vomissements) ; après 5/6 ans, cependant, la recherche de Rotavirus par coproculture n'est pas recommandée, car les patients sont presque tous immunisés.
