. Dans le diaphragme, il existe diverses ouvertures qui permettent le passage aux vaisseaux, aux nerfs et à d'autres structures, qui mènent de la cavité thoracique à la cavité abdominale et vice versa. L'une de ces ouvertures, appelée hiatus œsophagien, permet le passage de l'œsophage.
Dans la hernie glissante, la partie de l'estomac qui remonte dans le thorax est celle de passage entre l'œsophage et l'estomac ; cette région frontalière est appelée jonction gastro-œsophagienne ou cardia. Une fois que le cardia s'élève vers le haut, n'étant plus comprimé par le hiatus et subissant un désalignement par rapport à sa position naturelle, il perd sa fonction.Par conséquent, le cardia n'est plus en mesure d'empêcher efficacement le contenu acide de l'estomac dans l'œsophage.Un reflux gastro-œsophagien, trouble typique de la maladie, apparaît.