Il est important de distinguer la diarrhée aiguë de la diarrhée chronique, de localiser le problème dans l'intestin grêle ou le gros intestin et de comprendre si la diarrhée est due à une maladie gastro-intestinale primaire ou si elle est la conséquence d'une maladie extra-intestinale.
Compte tenu des différentes causes de diarrhée et de sa nature potentiellement auto-limitative, l'approche diagnostique doit varier en fonction des antécédents cliniques du patient, de la gravité des symptômes et de la disponibilité du propriétaire.
sont les causes les plus fréquentes. Dans ces cas, l'anamnèse est très importante (contact avec des animaux malades, intolérances connues, séjour au chenil, consommation d'aliments insuffisamment cuits ou avariés).La présence de mucus, de sang vivant, la difficulté et l'urgence à déféquer sont révélateurs d'un problème de gros intestin. , tandis que la perte de poids et le sang digéré indiquent une atteinte de l'intestin grêle.
Pour les animaux présentant une diarrhée légère, une consommation normale de nourriture et d'eau, aucun vomissement ni déshydratation, des soins de soutien sont souvent suffisants. En cas de progression des signes cliniques, avec déshydratation et perte d'appétit, des tests diagnostiques supplémentaires tels que des tests de selles, des tests de maladies infectieuses et des analyses de sang sont nécessaires, avec une attention particulière aux animaux présentant des signes de maladies systémiques.
La diarrhée chez les animaux de compagnie a été liée à Clostridium perfringens, Clostridium difficile, Campylobacter, Salmonella et E. coli. D'un autre côté, cependant, de nombreux animaux sains hébergent ces bactéries, et leur découverte n'implique pas nécessairement la présence de signes cliniques.
En particulier, il existe une corrélation apparente entre C. perfringens et diarrhée hémorragique aiguë, mais il n'est pas clair si la présence de cette bactérie en est la cause ou la conséquence, due à une « altération de la microflore intestinale ; il en est de même pour C. difficile.
Campylobacter, d'autre part, est capable de provoquer des symptômes gastro-intestinaux, en particulier chez les jeunes animaux exposés à des facteurs prédisposants tels que le stress, la surpopulation et les maladies concomitantes.
Certains types de E. coli peuvent provoquer des infections intestinales chez les chiens dont le système immunitaire est affaibli et sont souvent impliqués dans la colite granulomateuse du Boxer, avec des lésions similaires également décrites chez le bouledogue français et le border collie.