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Les héparines de bas poids moléculaire sont administrées par voie sous-cutanée. Normalement, les spécialités médicamenteuses qui les contiennent sont disponibles en seringues pré-dosées, donc pré-remplies et prêtes à l'emploi : le médicament peut être utilisé directement par le patient qui peut procéder à l'injection de manière totalement autonome.
Il faut cependant noter que l'injection est une pratique de santé : si elle n'est pas effectuée correctement, elle peut entraîner des effets secondaires (dans le cas de l'héparine, le risque le plus fréquent est la douleur ou l'apparition d'ecchymoses) voire des effets indésirables graves. Pour cette raison, en cas de doute, il est toujours nécessaire de consulter votre médecin avant de procéder.