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Plus précisément, le terme est utilisé pour désigner l'occupation de l'espace des cryptes (c'est-à-dire des cavités) présentes à la surface des glandes amygdales, par des débris infectieux, des dépôts de matière calcifiée ou des résidus alimentaires.
Les amygdales cryptiques sont associées à l'apparition de plaques blanchâtres et nauséabondes, de mauvaise haleine (halitose), de douleurs aux oreilles, de maux de gorge, de problèmes de déglutition et d'amygdales hypertrophiques.
Lorsque des sédiments d'origine alimentaire ou autre occupent l'espace des cryptes amygdaliennes et s'y déposent de façon permanente, ils peuvent donner lieu à une série de désagréments qui doivent être corrigés rapidement avec le traitement approprié.
A cet égard, une « évaluation clinique minutieuse par le » oto-rhino-laryngologiste permet d'identifier les causes exactes du trouble et d'établir les stratégies thérapeutiques les plus appropriées. Si les amygdales cryptiques sont à l'origine d'infections récidivantes graves et résistantes aux traitements médicamenteux, une indication est donnée à leur ablation (amygdalectomie).